The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains

Результат исследования: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаярецензирование

Аннотация

Current biology tasks are impracticable without bioinformatic data processing. Information technologies and the newest computers provide the ability to automatically execute algorithms on an extensive data set and store either strong- or weak-structured data. A well-designed architecture of such data warehouses increases the reproducibility of investigations. However, it is challenging to create a data schema that aids fast search of properties in such warehouses. This paper describes the method and its implementation for storing and processing microbiological and bioinformatical data. The web platform stores genomes in FASTA format, genome annotations in table files that indicate gene coordinates in the genomes, structural and mathematical models to compare different strains and predict new properties.

Язык оригиналаанглийский
Название основной публикацииParallel Computing Technologies - 16th International Conference, PaCT 2021, Proceedings
РедакторыVictor Malyshkin
ИздательSpringer Science and Business Media Deutschland GmbH
Страницы445-450
Число страниц6
ISBN (печатное издание)9783030863586
DOI
СостояниеОпубликовано - 2021
Событие16th International Conference on Parallel Computing Technologies, PaCT 2021 - Kaliningrad, Российская Федерация
Продолжительность: 13 сен 202118 сен 2021

Серия публикаций

НазваниеLecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
Том12942 LNCS
ISSN (печатное издание)0302-9743
ISSN (электронное издание)1611-3349

Конференция

Конференция16th International Conference on Parallel Computing Technologies, PaCT 2021
СтранаРоссийская Федерация
ГородKaliningrad
Период13.09.202118.09.2021

Предметные области OECD FOS+WOS

  • 1.02 КОМПЬЮТЕРНЫЕ И ИНФОРМАЦИОННЫЕ НАУКИ
  • 1.01 МАТЕМАТИКА

Fingerprint

Подробные сведения о темах исследования «The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать