Retrotransposons and the evolution of genome size in pisum

T. H.Noel Ellis, Alexander V. Vershinin

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатьярецензирование

Аннотация

Here we investigate the plant population genetics of retrotransposon insertion sites in pea to find out whether genetic drift and the neutral theory of molecular evolution can account for their abundance in the pea genome. (1) We asked whether two contrasting types of pea LTR-containing retrotransposons have the frequency and age distributions consistent with the behavior of neutral alleles and whether these parameters can explain the rate of change of genome size in legumes. (2) We used the recently assembled v1a pea genome sequence to obtain data on LTR-LTR divergence from which their age can be estimated. We coupled these data to prior information on the distribution of insertion site alleles. (3) We found that the age and frequency distribution data are consistent with the neutral theory. (4) We concluded that demographic processes are the underlying cause of genome size variation in legumes.

Язык оригиналаанглийский
Номер статьи24
Страницы (с-по)1-17
Число страниц17
ЖурналHigh-Throughput
Том9
Номер выпуска4
DOI
СостояниеОпубликовано - дек. 2020

Предметные области OECD FOS+WOS

  • 1.06.CQ БИОХИМИЯ И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ
  • 2.06.IG ИНЖЕНЕРИЯ, БИОМЕДИЦИНСКАЯ
  • 2.08.DB БИОТЕХНОЛОГИЯ И ПРИКЛАДНАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ
  • 2.04.II ИНЖЕНЕРИЯ, ХИМИЧЕСКАЯ

ГРНТИ

  • 34 БИОЛОГИЯ

Fingerprint

Подробные сведения о темах исследования «Retrotransposons and the evolution of genome size in pisum». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать