Quick search of neighbour particles in molecular dynamics simulations

P. L. Novikov, K. V. Pavsky, A. A. Baranov

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья по материалам конференциирецензирование

Аннотация

Quicksort algorithm as an assistant preliminary tool is proposed for acceleration of neighbour search procedure in the frame of molecular dynamics simulations. Simple estimations are made showing that the number of operations required to determine all the neighbours within a system of particles can be reduced by 2-3 orders of magnitude due to the preliminary sorting. Test molecular dynamics simulations carried out for virtual crystal structure containing atoms manifest 9-fold acceleration achieved by the modified algorithm.

Язык оригиналаанглийский
Номер статьи012036
ЖурналJournal of Physics: Conference Series
Том1680
Номер выпуска1
DOI
СостояниеОпубликовано - 21 дек 2020
Событие13th International Conference on Computer-Aided Technologies in Applied Mathematics, ICAM 2020 - Tomsk, Российская Федерация
Продолжительность: 7 сен 20209 сен 2020

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Quick search of neighbour particles in molecular dynamics simulations». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать