Functional study of potential regulatory SNPs (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs78317230, rs2072580, rs4796672)

Arina Degtyareva, Elena Leberfarb, Ilya Brusentsov, Tatiana Kuzina, Tatiana Merkulova

Результат исследования: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаярецензирование

Аннотация

In a previous study using a new bioinformatic approach based on Chip-Seq data with antibodies against various transcription factors and histone modifications, ChiA-PET, RNA-seq and ICGC data, 32 potentially regulatory single - nucleotide polymorphisms (rSNPs) were associated with colorectal cancer. In this study, a functional analysis of 6 of these polymorphisms was performed using EMSA and the luciferase reporter system. These nucleotide substitutions have been shown to alter the binding of nuclear extract proteins and influence the expression of the reporter gene.

Язык оригиналаанглийский
Название основной публикацииProceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020
ИздательInstitute of Electrical and Electronics Engineers Inc.
Страницы122-125
Число страниц4
ISBN (электронное издание)9781728195971
DOI
СостояниеОпубликовано - июл 2020
Событие2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020 - Novosibirsk, Российская Федерация
Продолжительность: 6 июл 202010 июл 2020

Серия публикаций

НазваниеProceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020

Конференция

Конференция2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020
СтранаРоссийская Федерация
ГородNovosibirsk
Период06.07.202010.07.2020

Предметные области OECD FOS+WOS

  • 1.02 КОМПЬЮТЕРНЫЕ И ИНФОРМАЦИОННЫЕ НАУКИ
  • 1.06 БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ
  • 3.01 ФУНДАМЕНТАЛЬНАЯ МЕДИЦИНА
  • 5.09 ПРОЧИЕ СОЦИАЛЬНЫЕ НАУКИ

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Functional study of potential regulatory SNPs (rs590352, rs11542583, rs3829202, rs78317230, rs2072580, rs4796672)». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать