Cascaded Training Pipeline for 3D Brain Tumor Segmentation

Minh Sao Khue Luu, Evgeniy Pavlovskiy

Результат исследования: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаярецензирование

Аннотация

We apply a cascaded training pipeline for the 3D U-Net to segment each brain tumor sub-region separately and chronologically. Firstly, the volumetric data of four modalities are used to segment the whole tumor in the first round of training. Then, our model combines the whole tumor segmentation with the mpMRI images to segment the tumor core. Finally, the network uses whole tumor and tumor core segmentations to predict enhancing tumor regions. Unlike the standard 3D U-Net, we use Group Normalization and Randomized Leaky Rectified Linear Unit in the encoding and decoding blocks. We achieved dice scores on the validation set of 88.84, 81.97, and 75.02 for whole tumor, tumor core, and enhancing tumor, respectively.

Язык оригиналаанглийский
Название основной публикацииBrainlesion: Glioma, Multiple Sclerosis, Stroke and Traumatic Brain Injuries - 7th International Workshop, BrainLes 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Revised Selected Papers
РедакторыAlessandro Crimi, Spyridon Bakas
ИздательSpringer Science and Business Media Deutschland GmbH
Страницы410-420
Число страниц11
ISBN (печатное издание)9783031089985
DOI
СостояниеОпубликовано - 2022
Событие7th International Brain Lesion Workshop, BrainLes 2021, held in conjunction with the Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, MICCAI 2021 - Virtual, Online
Продолжительность: 27 сен 202127 сен 2021

Серия публикаций

НазваниеLecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
Том12962 LNCS
ISSN (печатное издание)0302-9743
ISSN (электронное издание)1611-3349

Конференция

Конференция7th International Brain Lesion Workshop, BrainLes 2021, held in conjunction with the Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, MICCAI 2021
ГородVirtual, Online
Период27.09.202127.09.2021

Предметные области OECD FOS+WOS

  • 1.02 КОМПЬЮТЕРНЫЕ И ИНФОРМАЦИОННЫЕ НАУКИ
  • 1.01 МАТЕМАТИКА

Fingerprint

Подробные сведения о темах исследования «Cascaded Training Pipeline for 3D Brain Tumor Segmentation». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать