Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека

Z. S. Mustafin, S. A. Lashin, Y. G. Matushkin

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатьярецензирование

Аннотация

Филостратиграфический анализ - это подход к исследованию эволюции генов, позволяющий определить время возникновения генов за счет анализа филогенетических деревьев организмов, обладающих ортологичными к исследуемому генами. Такой анализ может открыть важные этапы в эволюции как организма в целом, так и групп функционально связанных генов, в частности генных сетей. В дополнение к исследованию времени возникновения гена изучается уровень его генетической изменчивости и то, какому типу отбора подвержен ген по отношению к наиболее близкородственным организмам. С помощью приложения Orthoscape были проанализированы генные сети из базы данных KEGG Pathway, Human Diseases, ассоциированные с заболеваниями человека. Выявлено, что большинство генов, описанных в генных сетях, подвержены стабилизирующему отбору, обнаружена высокая достоверная корреляция между временем возникновения гена и уровнем генетической изменчивости, которой он подвержен, - чем моложе ген, тем выше уровень генетической изменчивости. Было также показано, что среди проанализированных генных сетей наибольшая доля эволюционно молодых генов обнаружена в сетях, связанных с заболеваниями иммунной системы (65 %), а эволюционно древних генов - в сетях, ответственных за формирование зависимостей человека от веществ, вызывающих привыкание к химическим соединениям (88 %); генные сети, связанные с развитием инфекционных заболеваний, вызванных паразитами, достоверно обогащены эволюционно молодыми генами, а генные сети, ответственные за развитие специфических типов рака, - эволюционно древними генами.
Переведенное названиеPhylostratigraphic analysis of gene networks of human diseases
Язык оригиналарусский
Номер статьи5
Страницы (с-по)46-56
Число страниц11
ЖурналVavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii
Том25
Номер выпуска1
DOI
СостояниеОпубликовано - янв 2021

Предметные области OECD FOS+WOS

  • 3 МЕДИЦИНСКИЕ НАУКИ И ЗДРАВООХРАНЕНИЕ
  • 1.06 БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ
  • 4.01.AH СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО, МУЛЬТИДИСЦИПЛИНАРНОЕ
  • 1.06.KM ГЕНЕТИКА И НАСЛЕДСТВЕННОСТЬ

ГРНТИ

  • 34 БИОЛОГИЯ

Fingerprint

Подробные сведения о темах исследования «Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать