A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

I. N. Kiselev; I. R. Akberdin; A. Yu Vertyshev; Popov D.V.; F. A. Kolpakov

doi:10.17537/2019.14.373

A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

Переведенное название: Модульная графическая модель энергетического метаболизма в клетках скелетной мышцы

I. N. Kiselev, I. R. Akberdin, A. Yu Vertyshev, Popov D.V., F. A. Kolpakov

Кафедра информационной биологии ФЕН

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья

2 Цитирования (Scopus)

Аннотация

В работе представлена модификация многокомпартментной математической модели, описывающей функционирование скелетной мышцы в норме на уровне метаболизма клетки. Предложено модульное представление комплексной модели, которое обеспечивает возможность оперативного расширения и модификации компартментов модели для учета сложной организации мышечных клеток и ограничений скорости диффузии метаболитов между внутриклеточными компартментами. В качестве иллюстрации работы модели рассмотрен внутриклеточный ответ в работающей скелетной мышце при аэробном физическом упражнении с постоянной нагрузкой на велоэргометре. Модель доступна по адресу http://wiki.biouml.org/index.php/Muscle_metabolism

Переведенное название	Модульная графическая модель энергетического метаболизма в клетках скелетной мышцы
Язык оригинала	английский
Страницы (с-по)	373-392
Число страниц	20
Журнал	Mathematical Biology and Bioinformatics
Том	14
Номер выпуска	2
DOI	https://doi.org/10.17537/2019.14.373
Состояние	Опубликовано - 1 янв 2019

Ключевые слова

BioUML
Mathematical model
Metabolism
Module modeling approach
Physical exercise
Physiology
Skeletal muscle

ГРНТИ

34 БИОЛОГИЯ

Доступ к документу

10.17537/2019.14.373

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Модульная графическая модель энергетического метаболизма в клетках скелетной мышцы». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать

Kiselev, I. N., Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., D.V., P., & Kolpakov, F. A. (2019). A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle. Mathematical Biology and Bioinformatics, 14(2), 373-392. https://doi.org/10.17537/2019.14.373

@article{da2687e2337f48c7aba4247300785abd,

title = "A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle",

abstract = "The paper presents a modification of a multi-compartmental mathematical model describing the dynamics of intracellular species concentrations and fluxes in human muscle at rest. A modular representation of a complex model is proposed, which provides the possibility of rapid expansion and modification of the model compartments to account for the complex organization of muscle cells and the limitations of the rate of diffusion of metabolites between intracellular compartments. To illustrate the work of the model, intracellular response in human skeletal muscle to acute aerobic two-legged cycle ergometer training was considered.",

keywords = "BioUML, Mathematical model, Metabolism, Module modeling approach, Physical exercise, Physiology, Skeletal muscle",

author = "Kiselev, {I. N.} and Akberdin, {I. R.} and Vertyshev, {A. Yu} and Popov D.V. and Kolpakov, {F. A.}",

year = "2019",

month = jan,

day = "1",

doi = "10.17537/2019.14.373",

language = "English",

volume = "14",

pages = "373--392",

journal = "Mathematical Biology and Bioinformatics",

issn = "1994-6538",

publisher = "Institute of Mathematical Problems of Biology",

number = "2",

}

A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle. / Kiselev, I. N.; Akberdin, I. R.; Vertyshev, A. Yu; D.V., Popov; Kolpakov, F. A.

В: Mathematical Biology and Bioinformatics, Том 14, № 2, 01.01.2019, стр. 373-392.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья

TY - JOUR

T1 - A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

AU - Kiselev, I. N.

AU - Akberdin, I. R.

AU - Vertyshev, A. Yu

AU - D.V., Popov

AU - Kolpakov, F. A.

PY - 2019/1/1

Y1 - 2019/1/1

N2 - The paper presents a modification of a multi-compartmental mathematical model describing the dynamics of intracellular species concentrations and fluxes in human muscle at rest. A modular representation of a complex model is proposed, which provides the possibility of rapid expansion and modification of the model compartments to account for the complex organization of muscle cells and the limitations of the rate of diffusion of metabolites between intracellular compartments. To illustrate the work of the model, intracellular response in human skeletal muscle to acute aerobic two-legged cycle ergometer training was considered.

AB - The paper presents a modification of a multi-compartmental mathematical model describing the dynamics of intracellular species concentrations and fluxes in human muscle at rest. A modular representation of a complex model is proposed, which provides the possibility of rapid expansion and modification of the model compartments to account for the complex organization of muscle cells and the limitations of the rate of diffusion of metabolites between intracellular compartments. To illustrate the work of the model, intracellular response in human skeletal muscle to acute aerobic two-legged cycle ergometer training was considered.

KW - BioUML

KW - Mathematical model

KW - Metabolism

KW - Module modeling approach

KW - Physical exercise

KW - Physiology

KW - Skeletal muscle

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85072340586&partnerID=8YFLogxK

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=42429005

U2 - 10.17537/2019.14.373

DO - 10.17537/2019.14.373

M3 - Article

AN - SCOPUS:85072340586

VL - 14

SP - 373

EP - 392

JO - Mathematical Biology and Bioinformatics

JF - Mathematical Biology and Bioinformatics

SN - 1994-6538

IS - 2

ER -