The consensus rye microsatellite map with EST-SSRs transferred from wheat

Переведенное название: Консенсусная микросателлитная карта ржи с интегрированными EST-SSR маркерами пшеницы

D. O. Vidakovic, D. Perovic, T. V. Semilet, A. Börner, E. K. Khlestkina

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатьярецензирование

Аннотация

Микросателлитные (SSR) маркеры широко используют для картирования генов ржи и анализа транслокационных линий пшеницы и тритикале. SSR-маркеры с известной внутрихромосомной локализацией очень востребованы для картирования экономически значимых генов и QTL-анализа. Одним из источников новых SSR-маркеров у ржи являются микросателлитные маркеры пшеницы. Несмотря на несколько наборов микросателлитных маркеров, доступных у ржи, по-прежнему необходимо расширение списка SSR, сопоставленных с хромосомами ржи, поскольку на некоторых генетических картах количество SSR-маркеров невелико. Цель настоящего исследования состояла в том, чтобы интегрировать EST-SSR пшеницы в существующие генетические карты ржи и построить консенсусную микросателлитную карту ржи. Четыре картирующих популяции ржи (P87/P105, N6/N2, N7/N2 и N7/N6) тестировали с использованием праймеров CFE (EST-SSR). В результате в молекулярно-генетические карты ржи было интегрировано 23 микросателлитных локуса Xcfe : Xcfe023 , -136 и -266 на хромосоме 1R, Xcfe006 , -067 , -175 и -187 на 2R,Xcfe029 и -282 на 3R, Xcfe004, -100, -152, -224 и -260 на 4R, Xcfe037, -208 и -270 на 5R, Xcfe124, -159 и -277 на 6R,Xcfe010, -143 и -228 на 7R. За исключением Xcfe159 и Xcfe224, все картированные локусы Xcfe были обнаружены в ортологичных позициях с учетом множественных транслокаций в ходе эволюции генома ржи по сравнению с пшеницей. Консенсусная карта построена с использованием данных по четырем картирующим популяциям ржи. Она содержит в общей сложности 123 микросателлитных маркера, 12 SNP, 118 RFLP и 2 изоферментных локуса
Переведенное названиеКонсенсусная микросателлитная карта ржи с интегрированными EST-SSR маркерами пшеницы
Язык оригиналаанглийский
Страницы (с-по)459-464
Число страниц6
ЖурналVavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii
Том24
Номер выпуска5
DOI
СостояниеОпубликовано - 2020

Ключевые слова

  • Genetic mapping
  • Microsatellite markers
  • Secale cereale
  • SSR
  • Triticum aestivum

ГРНТИ

  • 34 БИОЛОГИЯ

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Консенсусная микросателлитная карта ржи с интегрированными EST-SSR маркерами пшеницы». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать