Genotyping of tick-borne encephalitis and Kemerovo viruses in taiga ticks collected in the Komi Republic

Переведенное название: Генотипирование возбудителей клещевого энцефалита и лихорадки Кемерово в таежных клещах, собранных в Республике Коми

M. Yu Kartashov, T. P. Mikryukova, E. I. Krivosheina, A. I. Kuznetsov, L. I. Glushkova, I. V. Korabel'nikov, Yu I. Egorova, V. A. Ternovoi, V. B. Loktev

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Аннотация

В последние годы регистрируется резкий рост случаев укусов иксодовыми клещами в северных регионах Европейской части России. В Республике Коми также резко увеличилось число лиц, обратившихся за медицинской помощью в связи с укусом клеща. Одновременно наблюдается рост заболеваемости клещевым энцефалитом, который особенно усилился с 2009 г. Информация о генетическом разнообразии возбудителей вирусных клещевых инфекций в этом регионе крайне ограничена. С целью идентификации и генотипирования возбудителей вирусных клещевых инфекций проведено исследование клещей I. persulcatus, собранных с растительности в южных и центральных районах Республики Коми. Методом ПЦР был выявлен генетический материал вирусов клещевого энцефалита и Кемерово в индивидуальных клещах. Секвенирование фрагментов генома этих вирусов позволило однозначно их идентифицировать. Генетический материал вируса клещевого энцефалита был выявлен в 6,8±1,2% случаев. Генотипирование выявленных изолятов, проведенное на основе анализа нуклеотидной последовательности фрагмента гена белка Е вируса клещевого энцефалита, позволило установить, что 35% изолятов относятся к дальневосточному генотипу, а 65% - к сибирскому генотипу вируса клещевого энцефалита. Филогенетический анализ секвенированных последовательностей показал наличие не менее четырех геновариантов сибирского и дальневосточного генотипов вируса клещевого энцефалита, близких к вариантам этого вируса, циркулирующим на Урале и в Сибири. Уровень инфицированности таежного клеща вирусом Кемерово составил 0,8±0,2%. Определение нуклеотидной последовательности фрагмента гена РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса Кемерово позволило установить, что обнаруженный генетический материал вируса Кемерово имеет уровень гомологии приблизительно 94% при сравнении с другими известными последовательностями этого орбивируса. Филогенетический анализ фрагментов генома вируса Кемерово показал наличие не менее двух геновариантов этого вируса, циркулирующих в Республике Коми. Высказано предположение, что вирус клещевого энцефалита был относительно недавно интродуцирован в природные очаги Республики Коми из Уральского и Сибирского регионов. Генетические отличия вируса Кемерово предполагают более длительную эволюцию в исследованных природных очагах этого региона. Обсуждается возможная роль птиц и клещей, паразитирующих на них, в быстром распространении вирусных клещевых инфекций в Республике Коми. Данные по генетическому разнообразию выявленных возбудителей клещевого энцефалита и лихорадки Кемерово могут быть полезны для улучшения диагностики, профилактики и лечения этих инфекционных заболеваний в Республике Коми
Переведенное названиеГенотипирование возбудителей клещевого энцефалита и лихорадки Кемерово в таежных клещах, собранных в Республике Коми
Язык оригиналаанглийский
Страницы (с-по)159-166
Число страниц8
ЖурналRussian Journal of Infection and Immunity
Том10
Номер выпуска1
DOI
СостояниеОпубликовано - 1 янв 2020

Ключевые слова

  • Genotyping
  • Ixodes persulcatus
  • Kemerovo virus
  • Komi Republic
  • PCR detection
  • Tick-borne encephalitis virus

ГРНТИ

  • 34.25 Вирусология

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Генотипирование возбудителей клещевого энцефалита и лихорадки Кемерово в таежных клещах, собранных в Республике Коми». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

  • Цитировать

    Kartashov, M. Y., Mikryukova, T. P., Krivosheina, E. I., Kuznetsov, A. I., Glushkova, L. I., Korabel'nikov, I. V., Egorova, Y. I., Ternovoi, V. A., & Loktev, V. B. (2020). Genotyping of tick-borne encephalitis and Kemerovo viruses in taiga ticks collected in the Komi Republic. Russian Journal of Infection and Immunity, 10(1), 159-166. https://doi.org/10.15789/2220-7619-GOT-1147