Differential alternative splicing in brain regions of rats selected for aggressive behavior

Переведенное название: Альтернативный сплайсинг в отделах головного мозга селектированных по агрессивности крыс

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Аннотация

Работа посвящена анализу изменений представленности альтернативных изоформ мРНК в отделах мозга линий крыс, моделирующих агрессивное и ручное поведение в результате длительного отбора (74 поколения). В работе рассмотрены основные методические аспекты RNA-Seq анализа дифференциального альтернативного сплайсинга. Найдено 2319 генов с альтернативно сплайсирующимися экзонами (АСЭ). Выявленные АСЭ сравнили с аннотированными в базах данных альтернативного сплайсинга и нашли 84% совпадений. С помощью кластеризации генов с зарегистрированными событиями АСЭ по онтологии обнаружено, что выборка обогащена нейронными генами синаптической специализации (FDR -17). У крыс с генетически обусловленной высокой или низкой степенью агрессии спектры экспрессии генов в различных участках мозга различаются по паттернам альтернативного сплайсинга. Максимальное число различных событий альтернативного сплайсинга (N=5), связанных с агрессивным поведением, было выявлено в гене Adcyap1r1. Проведен подробный анализ экспрессии гена субъединицы глутаматного рецептора Grin1, для которого показано достоверное отличие в распределении изоформ у агрессивных и ручных крыс. Это отличие может частично обусловливать поведенческий фенотип животных
Переведенное названиеАльтернативный сплайсинг в отделах головного мозга селектированных по агрессивности крыс
Язык оригиналаанглийский
Страницы (с-по)870-880
Число страниц11
ЖурналMolekuliarnaia biologiia
Том51
Номер выпуска5
DOI
СостояниеОпубликовано - 9 ноя 2017

Ключевые слова

  • Aggression
  • Alternative Splicing
  • Animals
  • Brain/metabolism
  • Male
  • RNA, Messenger/genetics
  • Rats
  • Receptors, N-Methyl-D-Aspartate/biosynthesis
  • Receptors, Pituitary Adenylate Cyclase-Activating Polypeptide, Type I/biosynthesis
  • Selective Breeding

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «Альтернативный сплайсинг в отделах головного мозга селектированных по агрессивности крыс». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать