Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики ФЕН

Профиль организации

профиль

Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики Факультета естественных наук НГУ создана в июне 2015 года в рамках проекта 5-100 в партнерстве с лабораторией профессора Иво Гроссе в университете Мартина Лютера Галле-Виттенберг (Германия). Основными сферами деятельности Лаборатории являются разработка методов компьютерного анализа данных полногеномного секвенирования и их применение для решения различных биологических задач. Важной задачей Лаборатории является воспитание специалистов в области компьютерной транскриптомики и биоинформатики, способных осуществлять анализ полногеномных данных, а также разрабатывать новые методы и алгоритмы для решения нестандартных задач.
Исследования в лаборатории ведутся по следующим направлениям:
1) изучение механизмов действия фитогормонов на развитие растений;
2) разработка «умных» компьютерных методов и программ для анализа Big Data в биологии;
3) исследование эволюции механизмов морфогенеза у растений на основании молекулярного филогенетического анализа

Стратегические академические единицы

  • Синтетическая биология

Fingerprint Узнайте самые подробные результаты анализа активности Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики ФЕН. Указанные в этом разделе метки относятся к работам этих участников организации. Вместе они формируют уникальную картину его активности.

  • Сеть Последние внешние коллаборации на уровне страны. Узнайте подробнее, нажав точки.

    Результат исследований

    3D Analysis of Mitosis Distribution Pattern in the Plant Root Tip with iRoCS Toolbox

    Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 янв 2020, В : Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2094, стр. 119-125 7 стр.

    Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  • Computer Simulation of the Evolution of Microbial Population: Overcoming Local Minima When Reaching a Peak on the Fitness Landscape

    Lashin, S. A., Mustafin, Z. S., Klimenko, A. I., Afonnikov, D. A. & Matushkin, Y. G., 1 фев 2020, В : Russian Journal of Genetics. 56, 2, стр. 242-252 11 стр.

    Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  • Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

    Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар 2020, В : Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

    Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  • 1 Цитирования (Scopus)

    Дипломные работы студентов

    Гены Pina и Pinb аллополипоидной пшеницы как мишень для направленного мутазенеза с целью изменения текстуры зерна

    Автор: Фомин, И. Н., 6 июн 2018

    Руководитель: Хлесткина, Е. К. (Научный руководитель) & Афонников, Д. А. (Научный руководитель)

    Диссертация студента: Выпускная квалификационная работаВКР магистра

    Компьютерное моделирование распределения ауксина в апикальной меристеме корня Arabidopsis thaliana c учетом анатомии корневого чехлика и нарушений в его структуре

    Автор: Савина, М. С., 4 дек 2019

    Руководитель: Миронова, В. В. (Научный руководитель)

    Диссертация студента: ДиссертацияКандидатская диссертация

    Компьютерный анализ и моделирование процессов формирования и поддержания структуры апикальной меристемы корня Arabidopsis thaliana L.

    Автор: Лавреха, В. В., 22 мая 2018

    Руководитель: Миронова, В. В. (Научный руководитель)

    Диссертация студента: ДиссертацияКандидатская диссертация