Результат исследований

Фильтр
статья
2020

Catalytically Competent Conformation of the Active Site of Human 8-Oxoguanine-DNA Glycosylase

Popov, A. V., Yudkina, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 17 фев 2020, В : Biochemistry (Moscow). 85, 2, стр. 192-204 13 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Mechanistic insight into the role of Poly(ADP-ribosyl)ation in DNA topology modulation and response to DNA damage

Matkarimov, B. T., Zharkov, D. O. & Saparbaev, M. K., янв 2020, В : Mutagenesis. 35, 1, стр. 107-118 12 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Requirements for DNA bubble structure for efficient cleavage by helix-two-turn-helix DNA glycosylases

Makasheva, K. A., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., янв 2020, В : Mutagenesis. 35, 1, стр. 119-128 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Self-cleaning photoactive cotton fabric modified with nanocrystalline TiO2 for efficient degradation of volatile organic compounds and DNA contaminants

Solovyeva, M., Selishchev, D., Cherepanova, S., Stepanov, G., Zhuravlev, E., Richter, V. & Kozlov, D., 15 мая 2020, В : Chemical Engineering Journal. 388, 124167.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2019

Antisense Oligonucleotides Immobilized on Silicon-Organic Nanoparticles as a Tool for Prolonged Correction of Hypertensive States

Levina, A. S., Repkova, M. N., Klimov, L. O., Ryazanova, M. A., Markel, A. L. & Zarytova, V. F., 15 мая 2019, В : Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 167, 1, стр. 116-119 4 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Are small nucleolar RNAs "cRISPRable"? A report on box C/D small nucleolar RNA editing in human cells

Filippova, J. A., Matveeva, A. M., Zhuravlev, E. S., Balakhonova, E. A., Prokhorova, D. V., Malanin, S. J., Mahmud, R. S., Grigoryeva, T. V., Anufrieva, K. S., Semenov, D. V., Vlassov, V. V. & Stepanov, G. A., 4 ноя 2019, В : Frontiers in Pharmacology. 10, 01246.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ

Conformational Dynamics of Damage Processing by Human DNA Glycosylase NEIL1

Kladova, O. A., Grin, I. R., Fedorova, O. S., Kuznetsov, N. A. & Zharkov, D. O., 15 мар 2019, В : Journal of Molecular Biology. 431, 6, стр. 1098-1112 15 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Critical Sites of DNA Backbone Integrity for Damaged Base Removal by Formamidopyrimidine-DNA Glycosylase

Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 18 июн 2019, В : Biochemistry. 58, 24, стр. 2740-2749 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Mechanism of stimulation of DNA binding of the transcription factors by human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE1

Bazlekowa-Karaban, M., Prorok, P., Baconnais, S., Taipakova, S., Akishev, Z., Zembrzuska, D., Popov, A. V., Endutkin, A. V., Groisman, R., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Bissenbaev, A., Le Cam, E., Zharkov, D. O., Tudek, B. & Saparbaev, M., 1 окт 2019, В : DNA Repair. 82, стр. 102698 102698.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

3 Цитирования (Scopus)

Observations on Protecting Groups in the Synthesis of Mono- and Triphosphates of Amino Alcohols

Sherstyuk, Y. V., Chalova, P. V., Silnikov, V. N. & Abramova, T. V., 4 мар 2019, В : Organic Preparations and Procedures International. 51, 2, стр. 182-191 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Photoinduced inhibition of DNA repair enzymes and the possible mechanism of photochemical transformations of the ruthenium nitrosyl complex [RuNO(β-Pic)2(NO2)2OH

Mikhailov, A. A., Khantakova, D. V., Nichiporenko, V. A., Glebov, E. M., Grivin, V. P., Plyusnin, V. F., Yanshole, V. V., Petrova, D. V., Kostin, G. A. & Grin, I. R., 11 дек 2019, В : Metallomics : integrated biometal science. 11, 12, стр. 1999-2009 11 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Platinum Polyoxoniobates Form Adducts with DNA

Yudkina, A. V., Sokolov, M. N., Abramov, P. A., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., 1 ноя 2019, В : Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 641-646 6 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Reading and misreading 8-oxoguanine, a paradigmatic ambiguous nucleobase

Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Endutkin, A. V., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 1 мая 2019, В : Crystals. 9, 5, 31 стр., 269.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ

Relative Efficiency of Recognition of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine by Methyl-Dependent DNA Endonuclease GlaI

Petrova, D. V., Naumenko, M. B., Khantakova, D. V., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., 1 ноя 2019, В : Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 625-629 5 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2018

2',3'-Dideoxyuridine triphosphate conjugated to SiO2 nanoparticles: Synthesis and evaluation of antiproliferative activity

Vasilyeva, S. V., Grin, I. R., Chelobanov, B. P. & Stetsenko, D. A., 15 апр 2018, В : Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 28, 7, стр. 1248-1251 4 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Aberrant repair initiated by the adenine-DNA glycosylase does not play a role in UV-induced mutagenesis in Escherichia coli

Zutterling, C., Mursalimov, A., Talhaoui, I., Koshenov, Z., Akishev, Z., Bissenbaev, A. K., Mazon, G., Geacintov, N. E., Gasparutto, D., Groisman, R., Zharkov, D. O., Matkarimov, B. T. & Saparbaev, M., 5 дек 2018, В : PeerJ. 6, 12, 23 стр., 6029.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Characterization of biochemical properties of an apurinic/apyrimidinic endonuclease from Helicobacter pylori

Turgimbayeva, A., Abeldenov, S., Zharkov, D. O., Ishchenko, A. A., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Khassenov, B., 15 авг 2018, В : PLoS ONE. 13, 8, стр. e0202232 26 стр., e0202232.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Characterization of primary normal and malignant breast cancer cell and their response to chemotherapy and immunostimulatory agents

Nushtaeva, A. A., Stepanov, G. A., Semenov, D. V., Juravlev, E. S., Balahonova, E. A., Gerasimov, A. V., Sidorov, S. V., Savelyev, E. I., Kuligina, E. V., Richter, V. A. & Koval, O. A., 9 июл 2018, В : BMC Cancer. 18, 1, стр. 728 11 стр., 728.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

4 Цитирования (Scopus)

Methods of the synthesis of silicon-containing nanoparticles intended for nucleic acid delivery

Levina, A. S., Repkova, M. N., Ismagilov, Z. R. & Zarytova, V. F., 7 сен 2018, В : Eurasian Chemico-Technological Journal. 20, 3, стр. 177-194 18 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Non-agglomerated silicon-organic nanoparticles and their nanocomplexes with oligonucleotides: Synthesis and properties

Levina, A. S., Repkova, M. N., Shikina, N. V., Ismagilov, Z. R., Yashnik, S. A., Semenov, D. V., Savinovskaya, Y. I., Mazurkova, N. A., Pyshnaya, I. A. & Zarytova, V. F., 21 сен 2018, В : Beilstein Journal of Nanotechnology. 9, 1, стр. 2516-2525 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)

Nucleotide modifications decrease innate immune response induced by synthetic analogs of snRNAs and snoRNAs

Stepanov, G., Zhuravlev, E., Shender, V., Nushtaeva, A., Balakhonova, E., Mozhaeva, E., Kasakin, M., Koval, V., Lomzov, A., Pavlyukov, M., Malyants, I., Zhorov, M., Kabilova, T., Chernolovskaya, E., Govorun, V., Kuligina, E., Semenov, D. & Richter, V., 2 ноя 2018, В : Genes. 9, 11, 18 стр., 531.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

6 Цитирования (Scopus)

Oxidative damage to epigenetically methylated sites affects DNA stability, dynamics and enzymatic demethylation

Gruber, D. R., Toner, J. J., Miears, H. L., Shernyukov, A. V., Kiryutin, A. S., Lomzov, A. A., Endutkin, A. V., Grin, I. R., Petrova, D. V., Kupryushkin, M. S., Yurkovskaya, A. V., Johnson, E. C., Okon, M., Bagryanskaya, E. G., Zharkov, D. O. & Smirnov, S. L., 16 ноя 2018, В : Nucleic Acids Research. 46, 20, стр. 10827-10839 13 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

5 Цитирования (Scopus)

Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сен 2018, В : DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Variable termination sites of DNA polymerases encountering a DNA–protein cross-link

Yudkina, A. V., Dvornikova, A. P. & Zharkov, D. O., 1 июн 2018, В : PLoS ONE. 13, 6, стр. e0198480 17 стр., 0198480.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)
2017

Correlated target search by uracil-DNA glycosylase in the presence of bulky adducts and DNA-binding ligands

Mechetin, G. V., Dyatlova, E. A., Sinyakov, A. N., Ryabinin, V. A., Vorobjev, P. E. & Zharkov, D. O., 1 янв 2017, В : Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 43, 1, стр. 23-28 6 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Dihydroartemisinin counteracts fibrotic portal hypertension via farnesoid X receptor-dependent inhibition of hepatic stellate cell contraction

Endutkin, A., Popov, A., Yudkina, A., Makasheva, K., Afonnikov, D., Simmerling, C. & Zharkov, D., 1 янв 2017, В : FEBS Journal. 284, 1, стр. 114-133 20 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Открытый доступ
10 Цитирования (Scopus)

DNA Deformation-Coupled Recognition of 8-Oxoguanine: Conformational Kinetic Gating in Human DNA Glycosylase

Li, H., Endutkin, A. V., Bergonzo, C., Fu, L., Grollman, A., Zharkov, D. O. & Simmerling, C., 22 фев 2017, В : Journal of the American Chemical Society. 139, 7, стр. 2682-2692 11 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

11 Цитирования (Scopus)

Effects of brain reninangiotensin system inhibition in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension

Klimov, L. O., Ryazanova, M. A., Fedoseeva, L. A. & Markel, A. L., 2017, В : Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 21, 6, стр. 735-741 7 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Global DNA dynamics of 8-oxoguanine repair by human OGG1 revealed by stopped-flow kinetics and molecular dynamics simulation

Lukina, M. V., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Zharkov, D. O. & Fedorova, O. S., 1 окт 2017, В : Molecular BioSystems. 13, 10, стр. 1954-1966 13 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

5 Цитирования (Scopus)

Impact of delivery method on antiviral activity of phosphodiester, phosphorothioate, and phosphoryl guanidine oligonucleotides in MDCK cells infected with H5N1 bird flu virus

Levina, A. S., Repkova, M. N., Chelobanov, B. P., Bessudnova, E. V., Mazurkova, N. A., Stetsenko, D. A. & Zarytova, V. F., 1 июл 2017, В : Molecular Biology. 51, 4, стр. 633-638 6 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Impact of Delivery Method on Antiviral Activity of Phosphodiester, Phosphorothioate, and Phosphoryl Guanidine Oligonucleotides in MDCK Cells Infected with H5N1 Bird Flu Virus

Levina, A. S., Repkova, M. N., Chelobanov, B. P., Bessudnova, E. V., Mazurkova, N. A., Stetsenko, D. A. & Zarytova, V. F., 1 июл 2017, В : Molekuliarnaia biologiia. 51, 4, стр. 717-723 7 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Influence of pyridine-like ligands on the structure, photochemical and biological properties of nitro-nitrosyl ruthenium complexes

Kostin, G. A., Mikhailov, A. A., Kuratieva, N. V., Pischur, D. P., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 7 авг 2017, В : New Journal of Chemistry. 41, 15, стр. 7758-7765 8 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

13 Цитирования (Scopus)

Molecular dynamics simulation of the opposite-base preference and interactions in the active site of formamidopyrimidine-DNA glycosylase

Popov, A. V., Endutkin, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 8 мая 2017, В : BMC Structural Biology. 17, 1, стр. 1-19 19 стр., 5.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

5 Цитирования (Scopus)

Nuclear delivery of oligonucleotides via nanocomposites based on TiO2 nanoparticles and polylysine

Chelobanov, B. P., Repkova, M. N., Baiborodin, S. I., Ryabchikova, E. I. & Stetsenko, D. A., 1 сен 2017, В : Molecular Biology. 51, 5, стр. 695-704 10 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

1 Цитирования (Scopus)

Nuclear delivery of oligonucleotides via nanocomposites based on TiO2 nanoparticles and polylysine

Chelobanov, B. P., Repkova, M. N., Baiborodin, S. I., Ryabchikova, E. I. & Stetsenko, D. A., 9 ноя 2017, В : Molekuliarnaia biologiia. 51, 5, стр. 797-808 12 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Recognition but no repair of abasic site in single-stranded DNA by human ribosomal uS3 protein residing within intact 40S subunit

Grosheva, A. S., Zharkov, D. O., Stahl, J., Gopanenko, A. V., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Graifer, D. M. & Karpova, G. G., 20 апр 2017, В : Nucleic Acids Research. 45, 7, стр. 3833-3843 11 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

4 Цитирования (Scopus)

Toward gene therapy of hypertension: Experimental study on hypertensive ISIAH rats

Repkova, M. N., Levina, A. S., Seryapina, A. A., Shikina, N. V., Bessudnova, E. V., Zarytova, V. F. & Markel, A. L., 1 апр 2017, В : Biochemistry (Moscow). 82, 4, стр. 454-457 4 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданияхстатья

2 Цитирования (Scopus)