Лаборатория белковой инженерии

2022

A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 февр. 2022, В: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Azo dyes containing 1,3,4-thiadiazole fragment: Synthesis and properties

Selivanova, G., Skolyapova, A., Wang, J., Karpova, E., Shundrina, I., Bagryanskaya, I. & Amosov, E., 28 янв. 2022, В: New Journal of Chemistry. 46, 4, стр. 1929-1942 14 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Base excision repair in non-canonical DNA structures

Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 977-978. 2 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

Bioorthogonality in the light of cell defense mechanisms: Interaction of non-natural nucleic acids with the base excision DNA repair system

Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 982. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., нояб. 2022, В: DNA Repair. 119, 10 стр., 103390.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., февр. 2022, В: Data in Brief. 40, 107760.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., окт. 2022, В: Cells. 11, 20, 3192.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., 30 янв. 2022, В: Journal of Molecular Biology. 434, 2, 167334.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

Переведенное название: Влияние метилирования ДНК на 3′→5′-экзонуклеазную активность основной апурин-апиримидиновой эндонуклеазы человека APEX1Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., янв. 2022, В: Biochemistry (Moscow). 87, 1, стр. 10-20 11 стр., 1.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Improving Stability and Specificity of CRISPR/Cas9 System by Selective Modification of Guide RNAs with 2'-fluoro and Locked Nucleic Acid Nucleotides

Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Vorobyeva, M., Vorobyev, P. & Novopashina, D., 3 нояб. 2022, В: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13460.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 1026. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

Переведенное название: Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средствYuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., авг. 2022, В: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, стр. 470-478 9 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 февр. 2022, В: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, стр. 303-314 12 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., 9 нояб. 2022, (Электронная публикация перед печатью) В: The CRISPR journal. 5, 6, стр. 799-812 14 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 июл. 2022, В: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › рецензирование

Открытый доступ

P₂O₅-Promoted Cyclization of Di[aryl(hetaryl)methyl] Malonic Acids as a Pathway to Fused Spiro[4.4]nonane-1,6-Diones

Ivanov, K. S., Riesebeck, T., Skolyapova, A., Liakisheva, I., Kazantsev, M. S., Sonina, A. A., Peshkov, R. Y. & Mostovich, E. A., 4 мар. 2022, В: Journal of Organic Chemistry. 87, 5, стр. 2456-2469 14 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., нояб. 2022, В: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., февр. 2022, В: Genes. 13, 2, 166.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Structure and function evolution in DNA repair

Жарков, Д. О., 2022, стр. 1027. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

Symmetric Spirenes: Promising Building Blocks for New Generation Opto-Electronic Materials

Шеповалов, К. М., Пешков, Р. Ю., Бенасси, Э. & Мостович, Е. А., 20 июн. 2022, В: Physical Chemistry Chemical Physics. 24, 27, стр. 16836-16851 16 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Transcriptional mutagenesis-based reporter system for the analysis of DNA repair

Ким, Д. В., Khobta, A. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 987. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

Активность экзонуклеазы nsp14 вируса SARS-CoV-2 по отношению к РНК с модифицированными 3′-концевыми нуклеотидами

Ююкина, С. К., 2022, стр. 103. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

1 Загрузки (Pure)

Влияние метилирования ДНК на 3′→5′-экзонуклеазную активность основной апурин-апиримидиновой эндонуклеазы человека APEX1

Ендуткин, А. В., Яценко, Д. Д. & Жарков, Д. О., 2022, В: Биохимия. 87, 1, стр. 3-15 13 стр., 1.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Генетические конструкции для исследования транскрипционного мутагенеза и репарации 8-оксогуанина в клетках человека

Чуприкова, М. С. & Ким, Д. В., 2022, стр. 99. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

1 Загрузки (Pure)

Генотоксичность и механизмы репарации ДНК-пептидных сшивок с АП-сайтами

Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 728. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

2 Загрузки (Pure)

Ингибиторы ДНК-гликозилаз как потенциальные терапевтические препараты

Жарков, Д. О., 2022, стр. 41. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средств

Ююкина, С. К. & Жарков, Д. О., 14 мар. 2022, В: Вестник РАН. 92, 8, стр. 737-746 10 стр., 5.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Модифицированные направляющие РНК для создания специфичной и регулируемой системы CRISPR/Cas9

Саковина, Л. В., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 656. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

Оптимизация экспрессии и тестирования активности ДНК-гликозилазы MUTYH млекопитающих

Кручинин, А. А., Шилкин, Е. С., Жарков, Д. О. & Макарова, А. В., 2022, стр. 125-126. 2 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

1 Загрузки (Pure)

Характеристика деметилирующей ДНК-гликозилазы ROS1 из Nicotiana tabacum L

Петрова, Д. В., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2022, В: Вавиловский журнал генетики и селекции. 26, 4, стр. 341-348 8 стр., 1.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Химиотерапевтические подходы в фармакологии : в 2 ч.: учеб.-метод. пособие: Ч. I. Синтез нуклеотидов, репликация, клеточное деление.

Жарков, Д. О. & Дворникова, А. П., 2022, Редакционно-издательский центр НГУ. 66 стр.

Результат исследования: Книги, отчёты, сборники › учебное-методическое пособие › рецензирование

Циклические направляющие РНК для создания фотоактивируемой системы CRISPR/Cas9

Иванская, Е. В., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 160. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы

Файл

Циклические направляющие РНК как компоненты фоторегулируемой системы геномного редактирования CRISPR/Cas9

Иванская, Е. В., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 182. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

2021

2’-Модифицированные направляющие РНК как компоненты системы геномного редактирования CRISPR/Cas9

Саковина, Л. В., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., окт. 2021, стр. 332. 1 стр.

Результат исследования: Материалы конференций › тезисы › рецензирование

Открытый доступ

A New Class of Uracil-DNA Glycosylase Inhibitors Active against Human and Vaccinia Virus Enzyme

Grin, I. R., Mechetin, G., Kasymov, R. D., Diatlova, E. A., Yudkina, A., Shchelkunov, S. N., Gileva, I. P., Denisova, A. A., Stepanov, G. A., Chilov, G. G. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2021, В: Molecules. 26, 21, 15 стр., 6668.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Boron-containing nucleosides as tools for boron-neutron capture therapy

Zharkov, D. O., Yudkina, A., Riesebeck, T., Loshchenova, P. S., Mostovich, E. A. & Dianov, G. L., 2021, В: American journal of cancer research. 11, 10, стр. 4668-4682 15 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › рецензирование

Chapter 8: Substrate specificities of DNA glycosylases in vitro and in vivo

Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2021, DNA Damage, DNA Repair and Disease: Volume 1. Dizdaroglu, M. & Lloyd, R. S. (ред.). London: Royal Society of Chemistry, Том 1. стр. 175-203 29 стр.

Результат исследования: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › глава (рецензируемая) › рецензирование

Characterization of Recombinant Endonuclease IV from Mycobacterium tuberculosis

Dymova, M. A., Endutkin, A. V., Polunovsky, V. V., Zakabunin, A. I., Khrapov, E. A., Torgasheva, N. A., Yudkina, A. V., Mechetin, G. V., Filipenko, M. L. & Zharkov, D. O., мар. 2021, В: Molecular Biology. 55, 2, стр. 225-233 9 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

DNA glycosylases for 8-oxoguanine repair in Staphylococcus aureus

Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Barmatov, A. E. & Zharkov, D. O., сент. 2021, В: DNA Repair. 105, стр. 103160 103160.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Evolutionary Origins of DNA Repair Pathways: Role of Oxygen Catastrophe in the Emergence of DNA Glycosylases

Prorok, P., Grin, I. R., Matkarimov, B. T., Ishchenko, A. A., Laval, J., Zharkov, D. O. & Saparbaev, M., июл. 2021, В: Cells. 10, 7, 1591.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › рецензирование

Открытый доступ

Файл

2 Загрузки (Pure)

Mild phenotype of knockouts of the major apurinic/apyrimidinic endonuclease APEX1 in a non-cancer human cell line

Kim, D. V., Kulishova, L. M., Torgasheva, N. A., Melentyev, V. S., Dianov, G. L., Medvedev, S. P., Zakian, S. M. & Zharkov, D. O., сент. 2021, В: PLoS ONE. 16, 9 September, e0257473.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Miscoding properties of abasic site adducts with methoxyamine, an antitumor base excision repair inhibitor

Yudkina, A., Shilkin, E., Boldinova, E., Makarova, A. & Zharkov, D., июл. 2021, В: FEBS Open Bio. 11, стр. 87-87 1 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › рецензирование

Molecular dynamics approach to identification of new OGG1 cancer-associated somatic variants with impaired activity

Popov, A. V., Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D., Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Makasheva, K. A., Raspopova, D. Y., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., 1 янв. 2021, В: Journal of Biological Chemistry. 296, 100229.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

1 Цитирования (Scopus)

Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

Akhmetova, E. A., Golyshev, V. M., Vokhtantcev, I. P., Meschaninova, M. I., Venyaminova, A. G. & Novopashina, D. S., мар. 2021, В: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 2, стр. 496-504 9 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Photoactivatable nanocrispr/cas9 system based on crrna reversibly immobilized on carbon nanoparticles

Semikolenova, O., Sakovina, L., Akhmetova, E., Kim, D., Vokhtantsev, I., Golyshev, V., Vorobyeva, M., Novopashin, S. & Novopashina, D., 1 окт. 2021, В: International Journal of Molecular Sciences. 22, 20, 10919.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Открытый доступ

Template Properties of 5-Methyl-2'-Deoxycytidine and 5-Hydroxymethyl-2'-Deoxycytidine in Reactions with Human Translesion and Reparative DNA Polymerases

Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Poltorachenko, V. A., Boldinova, E. O., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., мар. 2021, В: Molecular Biology. 55, 2, стр. 267-272 6 стр.

Результат исследования: Научные публикации в периодических изданиях › статья › рецензирование

Лаборатория белковой инженерии

Результат исследований

Поиск результатов